Коллектив, представляющий самый, пожалуй, именитый клуб Украины, был основан еще в 1965г. Вторая команда футбольного клуба «Динамо» (Киев) один сезон выступала в первенстве СССР. В 1965 году «Динамо-2» заняло 13-е место в одной из украинских зон класса «Б». С начала проведения чемпионатов независимой Украины «Динамо-2» — неизменный участник всех турниров первой лиги. С 1997 года команда стала лидером соревнований. За следующие семь сезонов «Динамо-2» трижды побеждало в дивизионе - в сезонах 1998/1999, 1999/2000 и 2000/2001 г.г., дважды было вторым в сезонах 1996/1997 и 1997/1998 г.г., и один раз третьим - в сезоне 2002/2003 г.г. Поскольку переход в высшую лигу вторых команд клубов не предусмотрен, киевляне оставались в первой лиге, пропуская вперед коллективы, шедшие следом. Достижения игроков «Динамо-2»: «Лучший футболист первой лиги» – А. Алиев в сезоне 2003/2004 г.г., «Лучший бомбардир первой лиги» – А. Антюхин – 22 мяча (1996/1997) и А.Алиев – 16 мячей в сезоне 2003/2004 г.г.. Но главной целью второй команды украинского гранда является не столько завоевание передовых позиций в первой лиге, сколько подготовка добротного пополнения для основного состава клуба.